1、作于1988年2月的《墙上的阳光》（见《方舟子诗文集》，http://www.xys.org/fang/doc/poetry/1994/yangguang.txt）“模仿”梁小斌发表于1980年的《雪白的墙》。（详细论证见亦明：《文史畸才方舟子之二•“装”出来的反叛诗人》）。

2、作于1988年12月的《眼蝶标本》（见《方舟子诗文集》，http://www.xys.org/fang/doc/poetry/1994/yandie.txt）“模仿”顾城发表于1979年的《眨眼》。（详细论证见亦明：《文史畸才方舟子之二•“装”出来的反叛诗人》）。

3、作于1993年9月的《侃明史〔十七〕――刘基》（见ACT网络，http://www.newsmth.net/bbsanc.php?path=%2Fgroups%2Fliteral.faq%2FHistory%2Fzhongguofenleilishi%2FAcientChina%2Fming%2Ffang-ming%2FM.898306844.A）抄袭明人李贽的《续藏书》。（详细论证见亦明：《文史畸才方舟子之三•“偷”出来的历史学家》。注：方舟子的《大明小史》主要根据《续藏书》写成，但在写完《刘基》之后不久，方舟子自己透露出了这个来源，因此不算是抄袭）。

4、作于1993年8月的《乱侃明史（之二）》（见ACT网络，http://www.newsmth.net/bbsanc.php?path=%2Fgroups%2Fliteral.faq%2FHistory%2Fzhongguofenleilishi%2FAcientChina%2Fming%2Ffang-ming%2FM.895930244.A）抄袭吴晗《朱元璋传》。（详细论证见亦明：《文史畸才方舟子之三•“偷”出来的历史学家》）。

5、作于1993年8月的《乱侃明史之十一――马皇后》（见ACT网络，http://www.newsmth.net/bbsanc.php?path=%2Fgroups%2Fliteral.faq%2FHistory%2Fzhongguofenleilishi%2FAcientChina%2Fming%2Ffang-ming%2FM.898219557.A）抄袭吴晗《朱元璋传》。（详细论证见亦明：《文史畸才方舟子之三•“偷”出来的历史学家》）。

6、作于1994年2月的《明初酷刑》（见《方舟子诗文集》，http://www.xys.org/fang/doc/history/yeming/kuxing.txt）抄袭吴晗《朱元璋传》。（详细论证见亦明：《文史畸才方舟子之三•“偷”出来的历史学家》）。

7、作于1994年9月的《功到雄奇即罪名》（见1994年9、10月《新语丝》月刊，http://www.xys.org/fang/doc/history/yeming/yuan.txt）通篇抄袭金庸《袁崇焕评传》。（详细论证见亦明：《文史畸才方舟子之三•“偷”出来的历史学家》）。

8、作于1995年5月的《科学是什么？》（见《方舟子诗文集》，http://www.xys.org/fang/doc/science/science.txt。注：现存文件已经被篡改。详见亦明：《从小偷到巨骗――方舟子的人生轨迹》，http://www.rainbowplan.org/bbs/topic.php?topic=126394&select=&forum=1）抄袭密歇根州立大学教授Robert Root-Bernstein的文章，On defining a scientific theory: Creationism considered。（详细论证见亦明：《方舟子早在1995年就抄袭MSU教授的英文文章》，2010年10月14日虹桥科教论坛，http://www.rainbowplan.org/bbs/topic.php?topic=120031&select=&forum=1）。

9、作于1999年4月的《郭沫若抄袭钱穆了吗？》（见1999年4月《新语丝》月刊，http://www.xys.org/xys/magazine/GB/1999/xys9904.txt）抄袭孔繁的《荀子评传》。（详细论证见亦明：《文史畸才方舟子之三•“偷”出来的历史学家》）。

10、作于2001年8月的《干细胞研究的是是非非》（见2001年8月30日《南方周末》，题目为《布什失策干细胞？》，http://www.xys.org/xys/netters/Fang-Zhouzi/science/stemcell.txt）抄袭2001年8月15日《纽约时报》文章， Age-Old Question Is New Again，作者 NICHOLAS WADE。（见：http://www.nytimes.com/2001/08/15/us/age-old-question-is-new-again.html）。（详细论证见亦明：《方舟子九年前曾抄袭〈纽约时报〉》，2010年11月10日虹桥科教论坛，http://www.rainbowplan.org/bbs/topic.php?topic=129134&select=&forum=1）。

11、作于2001年9月的《科学地解决道德难题？》（见2001年10月4日《南方周末》，http://www.xys.org/xys/netters/Fang-Zhouzi/science/moral.txt）抄袭2001年9月14日《科学》杂志J. D. Greene等人的An fMRI investigation of emotional engagement in moral judgment（详细论证见离乡客：《中英文对照，方舟子剽窃铁证如山》，http://www.csc.pku.edu.cn/art.php?sid=2393；刘华杰：《回顾一下方舟子的“搬运术”――打假英雄的双重标准》，http://www.csc.pku.edu.cn/page/pic/20050310154113_fang.pdf）。

12、作于2003年7月的《也来给清华大学刘兵教授批改英译汉作业――也来看看刘兵教授的英语水平》（XYS20030715，http://www.xys.org/xys/netters/Fang-Zhouzi/science/liubing2.txt）抄袭新语丝网友田牛的帖子，《有人出书，就难免有评论。我也讲几句》（见2003年7月15日新语丝读书论坛，http://www.xys.org/forum/messages/30000/34193.html）。（详细论证见亦明：《打架斗士方舟子•科学文化人案》）。

13、作于2003年7月的《岂能拿翻译凑文章》（XYS20030724，http://www.xys.org/xys/netters/Fang-Zhouzi/sohu/liubing5.txt）抄袭新语丝网友白开水的文章，《这是印象记述还是抄袭？――评刘兵教授的〈穿行在科学发现的历史丛林中――伦敦科学博物馆撷英〉》（XYS20030718，http://www.xys.org/xys/ebooks/others/science/dajia3/liubing2.txt）。（详细论证见亦明：《打架斗士方舟子•科学文化人案》）。

14、作于2004年8月的《植物中的神秘数字》（见2004年第9期《科学世界》，hhttp://www.xys.org/xys/netters/Fang-Zhouzi/science/goldenratio.txt）抄袭英国Ron Knott的Fibonacci's Rabbits（见：http://www.mcs.surrey.ac.uk/Personal/R.Knott/Fibonacci/fibnat.html#Rabbits）（详细论证见deeplove：《方舟子抄袭或剽窃的5个先例》，http://www.boxun.com/hero/2007/xys/41_1.shtml）

15、作于2005年3月的《“反应停”悲喜剧》（见2005年4月6日《中国青年报》，http://www.xys.org/xys/netters/Fang-Zhouzi/bingdian/thalidomide.txt）抄袭新语丝网友coyotejoy的《是邪还是正？――“反应停”(Thalidomide)的故事》（XYS20040801，http://www.xys.org/xys/ebooks/others/science/history/thalidomide.txt）（详细论证见deeplove：《方舟子抄袭或剽窃的5个先例》，http://www.boxun.com/hero/2007/xys/41_1.shtml）。

16、作于2006年的《误读“转基因”》（见《财经》《年刊2006：预测与战略》，http://www.xys.org/xys/netters/Fang-Zhouzi/xjb/transgenic15.txt）抄袭贾士荣《国际转基因作物的安全性争论――几个事件的剖析》（XYS20041216，http://www.xys.org/xys/ebooks/others/science/dajia5/rice5.txt）（详细论证见亦明：《科唬作家方舟子•卖良心》）。

17、作于2006年6月的《学生剽窃，导师有责》（见2006年6月22日《北京科技报》，http://www.xys.org/xys/netters/Fang-Zhouzi/bkb/plagiarism.txt）抄袭美国www.insidehighered.com 网站Doug Lederman 的Perceived Plagiarism at Ohio U. （见：www.insidehighered.com/news/2005/11/01/plagiarism）（详细论证见寻正：《方舟子连揭露剽窃的文章都敢剽！》，2009年8月17日德赛公园《方舟子现象》，http://www.de-sci.org/blogs/yijia/?p=35337）

18、作于2004年的《现代药物是怎么开发出来的》（见2006年12月11日《经济观察报》，http://www.xys.org/xys/netters/Fang-Zhouzi/jingji/drug.txt）抄袭新语丝网友颖河于2001年3月至5月间在新语丝上连载的《认识药物》的系列文章（见：http://www.xys.org/xys/ebooks/others/science/medicine/yaowu1.txt）。（详细论证见脆弱：《方舟子的《现代药物是怎么开发出来的》似乎有抄袭的嫌疑》，http://blog.sina.com.cn/s/blog_490f7660010005wl.html；白字秀才：《神秘的106天――扒开骗子的画皮》，http://bbs1.creaders.net/education/messages/318548.html；难度五级：《方舟子确实抄袭了颖河的文章》，http://bbs1.creaders.net/education/messages/325488.html）。

19、作于2009年4月的《蟑螂的民主决策》（见：2009年4月8日《中国青年报》，http://www.xys.org/xys/netters/Fang-Zhouzi/bingdian/cockroach.txt）抄袭美国http://dsc.discovery.com/网站Jennifer Viegas的Cockroaches live in a democracy（见：http://www.abc.net.au/science/news/stories/s1607034.htm）（详细论证见寻正：《也说说民主与小强》，2009年4月12日《寻正帝国》，http://www.xzdg.org/?s=%E4%B9%9F%E8%AF%B4%E8%AF%B4%E6%B0%91%E4%B8%BB%E4%B8%8E%E5%B0%8F%E5%BC%BA&searchbutton=Go!）

20、作于2010年3月的《转基因玉米更有益健康》（见2010年3月24日《中国青年报》，http://www.xys.org/xys/netters/Fang-Zhouzi/bingdian/corn.txt）抄袭美国http://westernfarmpress.com网站Bruce Chassy and Drew Kershen的Bt corn reduces serious birth defects （见：westernfarmpress.com/bt-corn-reduces-serious-birth-defects）（详细论证见六指：《转基因玉米的神话》，2010年3月25日虹桥科教论坛，http://www.rainbowplan.org/bbs/topic.php?topic=107689&select=&forum=1）