西方哲学从第一个阶段世界本源之争开始，就因为受到人为宗教的影响，形成了实体论和理念论的争论。实体论主张世界的本原是现实存在的物质；理念论认为世界的本原是某种精神性的存在。二者有一个共同的特点：就是没有把宗教所依存的自然现象看作是一种物质的存在。而在中国哲学认为这种物质叫“元气”。在西方哲学的物质世界里缺乏这样一种物质，导致西方哲学的宇宙观残缺不全一直保持到了现在。现代科学从认识微观世界的不确定现象到发现太空中的暗物质、暗能量，逐渐开始接触到“元气”这样一个物质世界，西方哲学也相应地走向衰落。现在西方哲学已经和宗教走到一起了，很多网站上面，哲学和宗教被合并在一个栏目；许多书店把哲学书籍与宗教书籍放在一块。