中日之间横亘一条无法填平的鸿沟，是日寇对中国实施了惨绝人寰的大屠杀、进行细菌战、强制征用并虐待劳工、残暴地侵害成千上万中国妇女、迟迟不解决遗弃化学武器等罄竹难书的法西斯暴行。时至今日，这个分歧仍然在不断加深：日本政客参拜供奉甲级战犯的靖国神社、否认战争罪行、叫嚣重新武装并不惜与中国在钓鱼岛一战等荒谬绝伦的行径就是主因。

过去，日本增进对华关系，一度是为了共同对付苏联威胁。苏联解体后，日本从根本上调整了对俄战略，中日共同对付某一安全威胁的战略需求消失了。而日本在战略上对华防范的一面有所增强，这就是自从小泉执政后中，日关系便呈现急剧降温的由来。

在最近的100多年时间里，中国饱偿凌辱，世界上的强国几乎都侵略过中国。但从没有一个国家象日本那样，长期占领中国并屠杀那么多中国人、手段又是那么残忍、那么灭绝人忄生。这种侵害从明代至今历经甲午战争、侵华战争，给中国带来巨大灾难同时还死不认错。这是因为日本文化中没有反省的成分、侵略者嗜血本质的结果。从日本人至今还不时参拜靖国神社、为侵略战争罪行开脱、否认自己的失败拒不赔偿这样的动作就可以看出来。

日本军国主义对中国的侵略和给中国人民造成的巨大伤害，留下了深刻的战争伤痕，同时不断否认战争罪行、继续窥伺和侵占中国的领土，是“中日建立友好合作关系”最大的绊脚石。日本曾经对中国进行残酷侵略，其间发生的大屠杀、细菌战、遗弃化学武器、强制征用劳工、掠夺无数文物财物、对妇女的残酷暴行等问题，都是带给中国人民深刻伤痕的表现。然而，尽管中日战争已经结束60多年，但日本社会甚至部分政界坚持否认侵略战争罪行的态度，让中日两国的“友好发展”道路始终布满荆棘，并形成两国之间巨大的分歧。